feat(engine): 添加MCP连接管理和工具集成功能

- 集成MCP连接管理器，支持MCP服务器连接
- 添加多种内置工具：ClarifyTool、CronTool、DelegateTool、ExecuteCodeTool、
  PatchFileTool、ProcessTool、SendMessageTool、SpawnTool、TerminalTool、
  TodoTool、WebFetchTool、WebSearchTool、WriteFileTool等
- 实现工具注册和装配功能
- 添加技能选择上下文参数
- 支持思考模式控制参数thinking_enabled

feat(coordinator): 重构任务执行计划器参数命名

- 将learning_candidate_enabled重命名为allow_candidate_generation
- 更新TeamGraphScheduler中的参数传递
- 修改LocalAgentRunner中的相关参数处理
- 更新README文档中的相应描述

refactor(context): 标准化工具调用参数格式

- 添加_json导入用于参数序列化
- 实现_provider_tool_calls方法标准化OpenAI兼容的工具调用载荷
- 修复工具调用中参数非字符串类型的序列化问题

refactor(session): 优化消息历史记录过滤逻辑

- 修改get_messages_as_conversation为基于运行状态过滤消息
- 排除未完成、失败或错误结束的运行记录
- 改进对话历史的可见性控制机制

fix(store): 修复FTS索引重建逻辑

- 添加异常处理防止FTS索引创建失败
- 实现_rebuild_fts_index方法重新构建全文搜索索引
- 优化索引触发器和表的维护流程

app-instance/backend/beaver/engine/session/search.py

@@ -70,6 +70,7 @@ class SessionSearchService:
         include_children: bool = False,
         source: str | None = None,
         exclude_sources: list[str] | None = None,
+        exclude_end_reasons: list[str] | None = None,
     ) -> list[dict[str, Any]]:
         """列出最近活跃的 session 及其摘要元数据。"""
 
@@ -85,6 +86,10 @@ class SessionSearchService:
             placeholders = ",".join("?" for _ in exclude_sources)
             clauses.append(f"source NOT IN ({placeholders})")
             params.extend(exclude_sources)
+        if exclude_end_reasons:
+            placeholders = ",".join("?" for _ in exclude_end_reasons)
+            clauses.append(f"(end_reason IS NULL OR end_reason NOT IN ({placeholders}))")
+            params.extend(exclude_end_reasons)
 
         where = f"WHERE {' AND '.join(clauses)}" if clauses else ""
         params.extend([limit, offset])